Bioinformatics and High Performance Computing (BIO-HPC)

Producción Científica

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- Antonio Jesús Banegas Luna, José Pedro Cerón Carrasco, Savíns Puertas Martín, Horacio Emilio Pérez. (2019). BRUSELAS: HPC generic and customizable software achitecture for 3D ligand-based virtual screening of large molecular databases. Journal of Chemical Information and Modeling. volumen 59. paginas 2805-20817.

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- Fahimeh Ghasemi, Alireza Mehridenhavi, Alfonso Pérez, Horacio Emilio Pérez. (2018). Neural network and deep-learning algorithms used in QSAR studies: merits and drawbacks. DRUG DISCOVERY TODAY. volumen 23. paginas 1784-1790.

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- Grazyna Budryn, Joanna Grzelczyk, Andrzej Jaskiewicz, Horacio Emilio Pérez, José Pedro Cerón Carrasco, Dorota Zyzelewicz. (2018). Evaluation of butyrylcholinesterase inhibitory activity by chlorogenic acids and coffee extracts assed in ITC and docking simulation models. Food Research.

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- taRgeted thErapy for adVanced colorEctal canceR paTients (REVERT). (2020-2023) 2023.

- Descubrimiento Y Optimización De Compuestos Bioactivos Mediante Técnicas Avanzadas De Química Computacional. (2019-2021) 2021.

- Descubrimiento y optimización de compuestos bioactivos mediante técnicas avanzadas de química computacional. Fundación Séneca - Agencia de Ciencia y Tecnología de la Región de Murcia (SÉNECA). (2019-2022) 2022.

- Exploración de mercado, viabilidad comercial y procesos de inteligencia competitiva del análisis de sensores sociales.. Fundación Séneca - Agencia de Ciencia y Tecnología de la Región de Murcia (SÉNECA). (2019) 2019.

- Explotación y comercialización de técnicas avanzadas de química computacional para el descubrimiento y optimización de fármacos y otros compuestos bioactivos. (2019) 2019.

- Explotación y comercialización de técnicas avanzadas de química computacional para el descubrimiento y optimización de fármacos y otros compuestos bioactivos. (2019) 2019.

- PLANIFICACIO?N Y GESTIO?N DE RECURSOS HI?DRICOS A PARTIR DE ANA?LISIS DE DATOS DE IoT (WATERoT). (2019-2021) 2021.

- Técnicas eficientes de análisis de datos para un mundo conectado. Fundación Séneca - Agencia de Ciencia y Tecnología de la Región de Murcia (SÉNECA). (2019-2021) 2021.

- Aproximación al abordaje farmacológico del adenocarcinoma serrado colorrectal: caracterización funcional de dianas terapéuticas y de sus inhibidores. (2018-2021) 2021.

- Desarrollo de técnicas avanzadas de descubrimiento de fármacos, su implementación en herramientas software y web, y su aplicación a contextos de relevancia farmacológica. (2018-2020) 2020.

- Discovery and design of conformational modulators in blood anticoagulation. Barcelona Supercomputing Center (0S0800099D). (2018-2019) 2019.

- Metástasis y trombosis de tumores digestivos. (2018) 2018.

- Planificación y gestión de recursos hídricos a partir de anaálisis de datos IoT (WATERoT).. Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (MICINN). (2018-2021) 2021.

- Commercialization of a Blind Docking Drug Discovery Technology. (2017) 2017.

- Exploring therapeutic options for serrated and high-grade microsatellite instability colorectal carcinomas. CORBEL (Coordinated Research Infrastructures Building Enduring Life-science Serv. (2017-2018) 2018.

- In silico analysis of bioactive peptides from invasive Halophila stipulacea. (2017-2018) 2018.

- Red de Computación de Altas Prestaciones sobre Arquitecturas Paralelas Heterogénas (CAPAP-H6). Redes de Excelencia, MINECO. (2017-2018) 2018.

- Searching for high biological activity of legume seeds based on different levels of modeling. National Science Centre (Poland). (2017-2018) 2018.

- Desarrollo holístico de aplicaciones emergentes en sistemas heterogéneos (HETEROLISTIC). Ministerio de Economía y Competitividad. (2016-2019) 2019.

- EXTENSIÓN DEL PROYECTO: Desarrollo en arquitecturas computacionales masivamente paralelas de una metodología para el descubrimiento y optimización de compuestos bioactivos y su aplicación a problemas de relevancia biológica. (2016-2017) 2017.

- Evaluation of a HPC-based Blind Docking Drug Discovery Technology as a startup opportunity. (2016) 2016.

- Search and design of new antithrombotic agents: Murcia - Porto Alegre Partnership. Fundación Séneca de la Región de Murcia. Convocatoria Jiménez Espada.. (2016) 2016.

- Advanced Computational Drug Discovery Technologies using High Performance Computing Architectures (ACDDT­HPC). FP7, TETRACOM. (2015-2016) 2016.

- Aplicación de métodos computacionales en el diseño de fármacos para el descubrimiento de nuevos agentes terapéuticos. (2015-2017) 2017.

- Aproximación al abordaje farmacológico del adenocarcinoma serrado colorrectal: caracterización funcional de dianas terapéuticas y de sus inhibidores. (2015-2018) 2018.

- Beca predoctoral Fundación Séneca. (2015-2018) 2018.

- Computación de altas prestaciones en el sector Pharma: una aproximación económica. (2015-2017) 2017.

- Desarrollo en arquitecturas computacionales masivamente paralelas de una metodología para el descubrimiento y optimización de compuestos bioactivos y su aplicación. Fundación Séneca. (2015-2016) 2016.

- Diseño Molecular de Nuevos Antiinflamatorios de actividad mejorada en deportistas en la Región de Murcia. CENTRO DE ALTO RENDIMIENTO DE LA REGIÓN DE MURCIA. (2015-2016) 2016.

- Diseño Molecular de Nuevos Antiinflamatorios de actividad mejorada en deportistas en la Región de Murcia. Centro de Alto Rendimiento de la Región de Murcia (A73228207). (2015-2016) 2016.

- Diseño computacional de nuevos fármacos antitumorales con triple acción: eficacia, selectividad y carácter antiinflamatorio. Fundación Séneca. (2015-2017) 2017.

- GPU Research Center. Nvidia Corporation. (2015-2016) 2016.

- LEVERAGING INTRA-CHIP/INTER-CHIP SILICON-PHOTONIC NETWORKS FOR DESIGNING NEXT-GENERATION ACCELERATORS. NATIONAL SCIENCE FOUNDATION (GA-1525474). (2015-2019) 2019.

- Contrato de prestación de servicios de "Dinámica Molecular". Fundación General de la Universidad Autónoma de Madrid (G80065279). (2014) 2014.

- Cuda Teaching Center. Nvdia Corporation. (2014-2015) 2015.

- DESARROLLO EN ARQUITECTURAS COMPUTACIONALES MASIVAMENTE PARALELAS DE UNA METODOLOGÍA PARA EL DESCUBRIMIENTO Y OPTIMIZACIÓN DE COMPUESTOS BIOACTIVOS Y SU APLICACIÓN A PROBLEMAS DE RELEVANCIA BIOLÓGICA. FUNDACION SENECA. AGENCIA DE CIENCIA Y TECNOLOGIA DE LA REGION DE MURCIA. (2014-2016) 2016.

- DISCOVERY OF NOVEL BLOOD ANTICOAGULANTS USING HYBRID ARTIFICAL INTELLIGENCE TECHNIQUES. NILS CIENCIA Y SOSTENIBILIDAD (ES07 ? EEA Grants). (2014-2015) 2015.

- DISCOVERY OF NOVEL BLOOD ANTICOAGULANTS USING HYBRID ARTIFICAL INTELLIGENCE TECHNIQUES. NILS Science and Sustainability. (2014-2015) 2015.

- Desarrollo en arquitecturas computacionales masivamente paralelas de una metodología para el descubrimiento y optimización de compuestos bioactivos y su aplicación a problemas de relevancia biológica. Fundación Séneca. (2014-2016) 2016.

- Development of biomedical applications in high performance ar-chitectures. Fundación Séneca. (2014-2017) 2017.

- High-Performance Modelling and Simulation for Big Data Applications (cHiPSet). Programa acciones COST http://www.cost.eu/about_cost. (2014-2017) 2017.

- NILS Science and Sustainability. EEA Grants, UE. (2014-2015) 2015.

- Nils: Discovery of novel blood anticoagulants using hybrid artificial intelligence technqiues. Science and Sustainability. (2014-2015) 2015.

- Nueva generacion de robot para el trading cuantitativo automatico con capacidades de calculo distribuido basado en aplicacion de metodos de redes neuronales y bayesiana (CDTI). CDTI. (2014-2017) 2017.

- Nueva generación de robot para el trading cuantitativo automático con capacidades de cálculo distribuido basado en aplicación de métodos de redes neuronales y bayesianas. Artificial Intelligence Talentum, S.L. (B73804882). (2014-2016) 2016.

- Simulación Atomística de la Evolución Estructural de Aleaciones de FeC. (2014-2016) 2016.

- DESARROLLO DE TECNICAS AVANZADAS DE DESCUBRIMIENTO DE FARMACOS, SU IMPLEMENTACION EN HERRAMIENTAS SOFTWARE Y WEB, Y SU APLICACION A CONTEXTOS DE RELEVANCIA FARMACOLOGICA. (2013-2016) 2016.

- SYSTEM-LEVEL RUN-TIME MANAGEMENT TECHNIQUES FOR ENERGY-EFFICIENT SILICON-PHOTONIC MANYCORE SYSTEMS. NATIONAL SCIENCE FOUNDATION (CCF-1149549). (2013-2014) 2014.

- Sistemas heterogéneos eficientes energéticamente. MINISTERIO DE ECONOMIA Y COMPETITIVIDAD. (2013-2015) 2015.

- Sistemas heterogéneos eficientes energéticamente. Proyectos de Investigación Fundamental no orientada 2012. (2013-2015) 2015.

- Aplicaciones biomédicas en arquitecturas masivamente paralelas. Fundación Séneca. (2012-2014) 2014.

- ELECTRO-PHOTONIC NETWORK-ON-CHIP ARCHITECTURES IN 1000+ CORE SYSTEMS. DEFENSE ADVANCED RESEARCH PROJECTS AGENCY (W911NF-12-1-0211). (2012-2014) 2014.

- DISEÑO, EVALUACIÓN Y EXPLOTACIÓN DE APLICACIONES BIOMÉDICAS PARA ARQUITECTURAS PARALELAS DE ALTAS PRESTACIONES Y BAJO COSTE. (2011-2014) 2014.

- Diseño, evaluación y explotación de aplicaciones biomédicas para arquitecturas paralelas de altas prestaciones y bajo coste.. Fundación Séneca. (2011-2013) 2013.

- Nuevas estrategias en control reseteado: Herramientas de análisis y diseño, Aplicaciones.. Ministerio de Ciencia y Tecnología. (2011-2013) 2013.

- ARQUITECTURAS DE SERVIDORES, APLICACIONES Y SERVICIOS. MINISTERIO DE EDUCACION Y CIENCIA (TIN2009-14475-C04-02). (2010-2012) 2012.

- Arquitecturas de servidores, aplicaciones y servicios (ASAS).. Ministerio de Ciencia e Innovación. (2010-2012) 2012.

- HIGH-THROUGHPUT IN-SILICO SCREENING IN HPC ARCHITECTURES FOR THE DISCOVERY OF NEW INHIBITORS AGAINST BLOOD DISEASES. (2010) 2010.

- PROPIEDADES CONFORMACIONALES Y DINÁMICAS EN DISOLUCIÓN DE MACROMOLÉCULAS BIOLÓGICAS, POLÍMEROS SINTÉTICOS Y COMPLEJOS MACROMOLECULARES. (2010-2012) 2012.

- Adaptación y optimización de código científico en entornos computacionales jerárquicos. Fundación Séneca. (2009-2011) 2011.

- ESTUDIO GENÉTICO Y ESTRUCTURAL DE LA ANTITROMBINA. DESARROLLO DE NUEVOS FÁRMACOS ANTICOAGULANTES. (2009-2010) 2010.

- MYCOTOXINS AS LEAD STRUCTURES AGAINST STAPHYLOCOCCI: NEW ANTIBACTERIAL AGENTS DERIVED FROM FUMIMYCIN. (2009) 2009.

- Caracterización electrofisiológica de las células productoras de insulina obtenidas a partir de células troncales adultas. Fundación Séneca. (2008) 2008.

- ESTRATEGIAS DE APLICACIÓN DE LA VIRTUALIZACIÓN AL ENTORNO DE LOS SUPERCOMPUTADORES. (2008-2011) 2011.

- Estrategias de aplicación de la virtualización al entorno de los supercomputadores.. Fundación SÉNECA. (2008-2010) 2010.

- INCORPORATING PROTEIN BACKBONE FLEXIBILITY AND INDUCED-FIT IN DRUG DISCOVERY. (2008-2009) 2009.

- METODOLOGIAS PARA LA SIMULACION NUMERICA Y CARACTERIZACION EXPERIMENTAL DE POLIMEROS SINTETICOS Y MACROMOLECULAS BIOLOGICAS. (2008-2012) 2012.

- DRUG DISCOVERY THROUGH PROTEIN-LIGAND DOCKING. (2007) 2007.

- NACOBIS. (2007) 2007.

- PORTING FLEXSCREEN TO THE CELL PROCESSOR. (2007) 2007.

- RATIONAL OPTIMIZATION OF CELLULAR ADHESION, CELLULAR DIFFERENTIATION, AND GROWTH OF HYDROPHOBINE AT NANOSCALE. (2007-2009) 2009.

- Sistemas de control basados en RESET: Aplicaciones en sistemas con retardos.. Ministerio de educación y ciencia. (2007-2010) 2010.

- ARQUITECTURAS FIABLES Y DE ALTAS PRESTACIONES PARA CENTROS DE PROCESO DE DATOS Y SERVIDORES DE INTERNET. MINISTERIO DE EDUCACION Y CIENCIA (PROGRAMA CONSOLIDER-INGENIO 2010). (2006-2009) 2009.

- DISEÑO DE UNA APLICACIÓN INFORMÁTICA PARA LA EVALUACIÓN DE LA EFICACIA TÉCNICA, TÁCTICA Y ESTRATÉGICA EN WATERPOLO. CONSEJO SUPERIOR DE DEPORTES. MINISTERIO DE EDUCACIÓN. (2006) 2006.

- PROPIEDADES DINÁMICAS DE SISTEMAS POLIMÉRICOS Y MACROMOLÉCULAS BIOLÓGICAS. (2006-2008) 2008.

- Neural Stem Cells and the Development of Cell Theraphy for Stroke. Wallenberg Neuroscience Center, Lund University Hospital. (2005-2006) 2006.

- SOPORTE NACIONAL AL ESTUDIO DE LAS VARIACIONES DEL NIVEL DEL MAR EN EL MEDITERRANEO y EL MAR NEGRO: UNA COMBINACION DE ALTIMETRIA, MAREOGRAFO Y MODELOS GENERALES DE CIRCULACION OCEANOGRAFICA. MINISTERIO DE EDUCACION Y CIENCIA. (2005-2006) 2006.

- Diseño de una bebida con elevado contenido en polifenoles y estudio de su efecto sobre la evolución del estrés oxidativo en enfermos de Alzheimer. UCAM-HERO ESPAÑA. (2004-2007) 2007.

- Obtaining Pancreatic Beta Cells from Human Intestinal Epithelial Cells (B-Cells). Comisión Europea. (2004) 2004.

- Defectos metabólicos y moleculares de la diabetes mellitus y sus complicaciones: terapia génica. Instituto de Salud Carlos III. (2003) 2003.

- AYUDAS A GRUPOS CONSOLIDADOS Y DE ALTO RENDIMIENTO. (2002) 2002.

- Bioingeniería del islote de Langerhans: reconstrucción de la función endocrina pancreática mediante células obtenidas a partir de células pluripotenciales embrionarias de ratón. Dirección General de Investigación. (2001-2003) 2003.

- GEODESIA ESPACIAL Y GEODINÁMICA: Determinación de Posicion de las Estaciones de. Programa Nacional del Espacio. (2001-2003) 2003.

- Breaktrough in nonlinear control (Nonlinear Control Network). Unión Europea. (1997-2001) 2001.

- Acuerdo de confidencialidad: assess and analyze the opportunity of collaborating jointly in pursuing the discovery of new compounds and targets in the context of coronaviruses: COVID-19, SARS-Cov, MERS-CoV and other viruses in the coronaviridae family of viruses. Ennaid Therapeutics (35-2480993). (2020) .

- Acuerdo de licencia entre Fundación Universitaria San Antonio, Universidad de Granada y Fundación para la Formación e Investigación Sanitarias(?Licensors?) y Ennaid Therapeutics, LLC(?Licensee?). Ennaid Therapeutics (35-2480993). (2020) .

- Cooperation agreement "Chemical structures with similar pharmakodyname properties as glycolic acid and D-lactate". Clínico de la Universidad de Munich (01). (2020) .

- EXCLUSIVE LICENSE AGREEMENT. Ennaid Therapeutics (35-2480993). (2020) .

- Identificación de fármacos inhibidores de la proteasa furina como estrategia preventiva frente a la enfermedad COVID-19 y sus ensayos clínicos a través de la empresa Ennaid Therapeutics. Universidad Católica de Murcia (G30626303). (2020) .

- Refinamiento de Rseultados de Modelado Molecular. Villapharma Research (B73258915). (2020) .

- Acuerdo de Confidencialidad entre la Universidad Católica de Murcia y The University Of Sheffield. University Of Sheffield (RC0000667). (2019) .

- Acuerdo de Confidencialidad entre la Universidad Cátolica de Murcia y Karyopharm. Karyopharm Therapeutics (0101010410). (2019) .

- Acuerdo de confidencialidad entre la Universidad Cátolica de Murcia y Buggypower, S.L.. Buggypower, S.L. (B73532657). (2019) .

- Acuerdo de transferencia de material entre la agencia estatal consejo superior de investigaión científica, M.P. y Universidad Católica de Murcia. Agencia Estatal Consejo Superior de Investigaciónes Científicas (Q2818002D). (2019) .

- Doctorado Industrial entre la Universidad Católica San Antonio de Murcia y la Empresa Centro Tecnológico de las Tecnologías de la Información y las Comunicaciones. Centro Tecnológico de las Tecnologías de la Información y las Comunicaciones (G73346959). (2019) .

- Framework Agreement for Collaboration on Research between the Catholic University San Antonio in Murcia and University of Ferrara. University of Ferrara (AR 4749363). (2019) .

- Hibridación de Biotecnología y Herramientas 4.0 en la Industria Agroalimentaria para el desarrollo acelerado de nuevas formulaciones. El futuro de la alimentación funcional y personalizada. HIJOS DE RIVERA S. A. U. (A15002637). (2019) .

- Lincencia de Patente Zika. Versitech Limited (91/04539). (2019) .

- Machine Learning aplicado al rendimiento personal. MILEYENDA ENTERTAIMENT (B73763278). (2019) .

- Refinamiento de resultados de modelado molecular 2019. Villapharma Research (B73258915). (2019) .

- Contrato de investigación y desarrollo entre Villapharma Research y la UCAM para el desarrollo del proyecto de investigación "Refinamiento de resultados de modelado molecular". (2018) .

- Análisis de fuentes de información diversas (Crowdsourcing) para el establecimiento de un protocolo de actuación orientado a la resolución de conflictos relacionados con el agua en El Salvador. Vielca Ingenieros, S.A.. (2017) .

- Análisis de la información proveniente de las estaciones hidrometeorológicas telemétricas. Vielca Ingenieros, S.A.,. (2017) .

- Contrato de investigación y desarrollo entre Villapharma Research y la UCAM para el desarrollo del proyecto de investigación "Refinamiento de resultados de modelado molecular". (2016) .

- Contrato de investigación y desarrollo entre Villapharma Research y la UCAM para el desarrollo del proyecto de investigación "Refinamiento de resultados de modelado molecular". (2016) .

- Prestación de servicios de modelado molecular a Villapharma. Villapharma. (2016) .

- Doctorado Industrial UCAM con Artificial Intelligence Talentum SL. UCAM y Artificial Intelligence Talentum SL. (2015) .

- Doctorado Industrial UCAM con Villapharma. UCAM y Villapharma. (2015) .

- Prestación de servicios de Dinámica Molecular. Instituto Téofilo Hernández. (2014) .

- Prestación de servicios de docking. Instituto Téofilo Hernández. (2014) .

- DESRROLLO DE MODELOS QSAR PARA PREDECIR MUTAGENICIDAD DE SUSTANCIAS QUIMICAS USANDO TECNICAS ESTADISTICAS Y DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL. UNIVERSIDAD CATOLICA DE MURCIA. (2013) .

- Desarrollo de una metodología para el diseño de la red de carriles bici mediante TIC y geolocalizadores. Ayuntamiento de Murcia. (2013) .

- ONTOSAKAI: HERRAMIENTAS PARA LA OPTIMIZACION DE ENTORNOS EN APRENDIZAJE VIRTUAL MEDIANTE ANALISIS SEMANTICO Y LA GESTION DE PERFILES. UNIVERSIDAD CATOLICA SAN ANTONIO, MURCIA. (2013) .

- Ontosakai: Herramientas Para la Optimización de Entornos de Aprendizaje Virtual Mediante Análisis Semántico y la Gestión de Perfiles. Universidad Católica San Antonio de Murcia. (2013) .

- Desarrollo de una metodología para el diseño de la red de carriles bici mediante TIC y geolocalizadores. MOVE Programme (EU). (2012) .

- Innovación en metodologías enseñanza-aprendizaje: desarrollo de herramientas de soporte a la evaluación basada en competencias. Universidad Católica San Antonio de Murcia. (2011) .

- Registro de las sustancias pentrita y nitrato de monometil amonio en el marco del reglamento Reach. MAXAM CORP. HOLDING. (2010) .

- Plataforma de integración para sistemas controlables a través de Internet. PMAFI-PI-14/1C/05. Universidad Católica San Antonio de Murcia. (2004) .

- Adquisición de conocimiento de bases de datos utilizando lógica fuzzy. Cajamurcia. (2003) .

- Control Automatizado a través de Internet. . PMAFI-PI-09/1C/01. Universidad Católica San Antonio de Murcia. (2002) .